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BioWave  Vol. 13 No. 8 등록 2011.08.08 
인하대학교 해양 환경미생물학 연구실 | 조장천 교수
실험실 소개
지구에 존재하는 생명체 중 미생물은 가장 작은 생명체이지만, 그 크기와는 반대로 가장 거대한 양의 생물량을 지니고 있습니다. 또한 생태계 안에서 분해자(Decomposer), 조절자(Regulator), 연결자(Linker) 등 물질 및 에너지 순환의 핵심적인 역할을 수행하고 있습니다. 그러나 우리가 익히 알고 있는 배양된 미생물은 아주 일부에 지나지 않으며, 아직까지도 99% 이상의 미생물은 배양이 되고 있지 않은 상태입니다.

본 연구실은 자연 환경, 특히 해양 환경을 대상으로 다양한 배양학적 방법 및 분자생태학적 방법을 사용하여 이들의 분포, 역할, 유전체 기능을 밝힘으로써 해양생명연구의 원천재료를 확보하고 지구생태계를 유지하는 생태적 기능을 이해하고자 하는 연구실입니다.

본 연구실에서는 실험실 시작 시기부터 현재까지 고효율배양방법(High Throughput Culturing)을 다양한 환경에 적용하여, 새로운 문(phylum), 목(order)를 비롯하여 해양환경에서 중요역할을 수행하는 주요 미생물인 SAR11 group 3, SAR116 그룹 등을 최초로 배양하고, 이들의 유전체를 해독하였습니다.

현재 수행하고 있는 주요 연구 분야는 남극과 북극의 해양생태계에서 우점하는 미생물군에 대한 환경시스템생물학적 (Ecosystems biology) 연구, phage-host 시스템 발굴 및 phage virome 분석, 미생물 분리 및 탐색 기술의 개발을 통한 우리나라 연안에 서식하는 해양미생물의 인벤토리 분석, 해양 생태계 우점종(SAR11, SAR116)에 대한 비교-발현 유전체학 연구, 다양한 서식 환경에서 분리한 미생물의 다상분류 등이 있습니다.

본 연구실의 교수 및 대학원생들은 지금도 생명과학, 해양미생물학의 초석을 다진다는 각오로 자신들의 꿈을 향해 힘차게 달리고 있습니다. 저희 실험실은 관심과 열정을 가지고 계시는 분들에게 항상 열려있으니, 궁금하신 내용이 있으시면 언제든지 문의해주세요.

특히 본 연구실은 2011년, 제 1 호 극지연구협동실험실(KOPRI Collaboration & Development Laboratory)로 지정되었고, PI인 조장천 교수는 2009년부터 Inha Fellow Professor로 재직 중입니다.

연구분야
- 한반도 연안해양 및 원양, 극지환경에 서식하는 미생물의 분자다양성 연구 및 배양 연구
- 대양일주 (인천-북극, 인천-남극)를 통한 신규 해양미생물의 분포확인 및 배양연구
- 특수 해양환경 및 극한환경의 미생물학
- 콜로니 무형성 해양 우점미생물 분리를 위한 방법론 개발
- Marine phototrophic bacteria (SAR11, SAR116, OM60 등)의 배양 및 생리적 특성 연구
- 난배양성 미생물의 배양을 통한 유전체, 발현유전체, 단백질체 연구
- 고효율 유세포 분석기술을 이용한 phage-host 시스템 발굴 및 virome 분석 연구
연구성과

2007년 이후 대표논문

  • Oh, H.-M., I. Kang, K. Lee, Y. Jang, S.-I. Lim, and J.-C. Cho. (2011)
    Complete Genome Sequence of Strain IMCC9063, Belonging to SAR11 Subgroup 3, Isolated from the Arctic Ocean.
    J. Bacteriol. 193: 3379-3380

  • Y. Jang, H.-M. Oh, I. Kang, K. Lee, S.-J. Yang, J.-C. Cho. (2011)
    Genome Sequence of Strain IMCC3088, a Proteorhodopsin-Containing Marine Bacterium Belonging to the OM60/NOR5 Clade.
    J. Bacteriol. 193: 3415-3416

  • Oh, H.-M., K. K. Kwon, I. Kang, S. G. Kang, J.-H. Lee, S.-J. Kim, and J.-C. Cho. (2010)
    Complete Genome Sequence of "Candidatus Puniceispirillum marinum" IMCC1322, a Representative of the SAR116 Clade in the Alphaproteobacteria.
    J. Bacteriol. 192: 3240-3241

  • Oh, H.-M., H. Kim, K.-M. Kim, G.-S. Min, and J.-C. Cho. (2010)
    Porticoccus litoralis gen. nov., sp. nov., a gammaproteobacterium isolated from the Yellow Sea.
    Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60(4): 727-732

  • Song, J., H.-M. Oh, and J.-C. Cho. (2009)
    Improved culturability of SAR11 strains in dilution-to-extinction culturing from the East Sea, West Pacific Ocean.
    FEMS Microbiol. Lett.295(2):141-147

  • Giovannoni, S. J., D. H. Hayakawa, H. J. Tripp, U. Stingl, S. A. Givan, J.-C. Cho, H.-M. Oh, J. B. Kitner, K. L. Vergin and M. S. Rappe. (2008)
    The small genome of an abundant coastal ocean methylotroph.
    Environ Microbiol. 10: 1771-1782

  • Stingl U., J.-C. Cho, W. Foo, K. L. Versin, B Lanoil and S. J. Giovannoni. (2008)
    Dilution-to-Extinction Culturing of Psychrotolerant Planktonic Bacteria from Permanently Ice-covered Lakes in the McMurdo Dry Valleys, Antarctica.
    Microb. Ecol. 55: 395-405

  • Song, J., Y.-J. Choo and J.-C. Cho. (2008)
    Perlucidibaca piscinaegen. nov., sp. nov., a freshwater bacterium belonging to the family Moraxellaceae.
    Int. J. Syst. Evol. Microbiol.58(1): 97 - 102

  • Kim, H.,Y.-J. Choo, J. andJ.-C. Cho. (2007)
    Litoricolaceaefam. nov., to include Litoricola lipolyticagen. nov., sp. nov., a marine bacterium belonging to the order Oceanospirillales.
    Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57:1793-1798

  • Cho, J.-C., M. D. Stapels, R. M. Morris, K. L. Vergin, M. S. Schwalbach, S. A. Givan, D. F. Barofsky, and S. J. Giovannoni. (2007)
    Polyphyletic photosynthetic reaction centre genes in oligotrophic marine Gammaproteobacteria.
    Environ. Microbiol.9(6):1456-1463

  • Choo,Y.-J., K. Lee, J. Song andJ.-C. Cho. (2007)
    Puniceicoccus vermicolagen. nov., sp. nov., a novel marine bacterium, and description of Puniceicoccaceaefam. nov., Puniceicoccalesord. nov., Opitutaceaefam. nov., Opitutalesord. nov. and Opitutaeclassis nov. in the phylum 'Verrucomicrobia'.
    Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 57(3): 532-537

실험실 멤버들

  • 지도교수 : 조장천 교수

  • 연구교수 : 강일남, Rashedul islam
  • 박사과정 : 이기영, 양승조, 최아영
  • 석사과정 : 최재희, 장윤라, 장하니, 강동민
  • 연구원 : 권오희

    Contact :032-860-7711/032-876-5541 (Tel.) 032-232-0541 (Fax) | Homepage
  • 본 정보는 해당 기관에서 제공한 자료를 바탕으로 구성된 내용으로, BRIC에서 자체 생산한 정보가 아님을 밝혀드립니다. 또한 소개된 내용에서 중요하게 판단되는 부분은 해당 기관에 추가적으로 사실 확인 작업을 하시길 부탁드립니다.
     
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