과학자들이 간세포 암종(hepatocellular carcinoma) 세포에서 활성화되어 있는 유전자들을 분석함으로써 간암이 전이된 것인지의 여부를 예측하는 것이 가능하게 되었다.
국립 암연구소 (National Cancer Institute (NCI))연구진은 상하이의 푸단 대 간 암 연구소(Liver Cancer Institute of Fudan University)와 공동 연구로 전이하는 간암에만 특정적으로 존재하는 유전자 활성 패턴을 규명하였다. 이는 학술지 Nature medicine지 전자 출판으로 지난 3월 17일 발표되었다. 암이 전이될 것인지를 판단하는 것은 내과의가 환자에 대한 치료법을 결정하는데 도움이 된다.
또한 연구진은 전이에 요구되는 특정 유전자도 규명하였다. 오스테오폰틴(osteopontin,)이라 알려진 유전자가 전이에 요구되는 유전자로 규명되었는데 이는 전이에 대한 진단적 마커로 유용하게 이용될지 모른다.
간세포 암종((hepatocellular carcinoma))은 세계적으로 가장 흔하고 공격성이 강한 악성 종양이다. 비록 미국내에서는 발생률이 낮으나 간염 감염과 아플라톡신(aflatoxin)에 의한 식품 오염 같은 암 위험 인자가 있는 아시아와 아프리카에서는 발생률이 높다. 간세포 암종 환자의 낮은 생존률은 간암 세포의 다른 장기로의 전이에 기인한다.
전이할 확률이 높은 간 종양과 전이할 것 같지 않은 종양 사이의 핵심적 차이를 알아보기 위해 연구진은 여러 종양 샘플에서 유전자 활성을 비교하였다. 모든 종양 샘플은 종양이 나중에 전이될지 안될지 상관없이 모두 환자의 원 종양에서 채검되었다.
유전자 활성을 조사하기 위해 연구진은 DNA microarray 을 이용하였다. 종양 세포에서의 RNA 을 형광 마커로 표식한 후 RNA 전사체에 상응하는 DNA 에 결합하도록 한후 결합에 반응하여 나타나는 빛의 패턴과 강도에 따라 유전자를 분석할 수 있었다. 종양 세포내 9000개 이상의 유전자 활성을 분석한 후 컴퓨터 알고리즘은 153개의 유전자가 전이될 종양과 그렇지 않은 종양 사이에서 다르게 발현됨을 알아냈다.
이들 유전자를 대상으로 실제로 전이와의 상관 관계를 측정하기 위해 환자의 임상 결과가 알려진 경우를 비교한 결과 전이성 암의 경우 82%의 정확도와 비전이성의 경우 67%의 정확도를 나타냈다.
연구진은 전이 성격을 높게 나타내는 한 핵심 유전자를 규명했는데 이 유전자는 오스테오폰틴이라는 단백질을 생산한다. 이 유전자의 높은 활성이 종양 세포내에서 높은 오스테오폰틴 단백질의 발현을 일으키고 전이를 촉진하는 것으로 나타났다. 이 단백질의 활성을 차단함으로써 종양이 퍼지는 것을 방지할 수 있슴이 마우스와 세포 수준에서 발견할 수 있었다. 따라서 오스테오폰틴은 암이 전이될지의 여부뿐만 아니라 간세포 암종의 잠재적인 치료적 표적으로 유용할 지 모른다.
오스테오폰틴은 체액에서 발견되어지고 세포밖에 위치하고 있어서 약물에 의해 쉽게 접근될 수 있을지 모른다고 주 연구자인 국립 암연구소의 Xin Wei Wang는 말했다.
원본 논문:
Ye Q, et al. Predicting hepatitis B virus-positive metastatic hepatocellular carcinoma using gene expression profiling and supervised machine learning. Nature Medicine 2003. Available online March 17, 2003, at http://www.nature.com/nm.
출처: http://www.cancer.gov/newscenter/pressreleases/HCC
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