|
|
|
|
2001. 4. 10. |
|
바이로이드는 감염성이 있는 환형 단일가닥 RNA로 246에서 399 뉴클레오티드로 구성되어 있으며, 식물에서 알려진 병원체 중 가장 작은 병원체로 경제적으로 중요한 몇 몇 작물에 심각한 피해를 일으킨다. 바이로이드는 기능성 단백질을 암호하지 않기 때문에 자신의 복제를 위해서 식물의 대사작용에 의존한다.
대다수 바이로이드의 유전자에는 다섯 개의 도메인이 있는데 유전자 양쪽 끝에 left (TL)와 right (TR) 도메인이 존재하고, 중앙의 보존부위(central conserved region, CCR)에는 병원성도메인(pathogenic, P), 변화도메인(variable, V), 중앙도메인이 있다. CCR이 부족한 바이로이드는 hammerhead self-cleavage 능력을 갖는데 이것은 바이로이드의 복제과정에 근본적인 차이를 일으킨다.
CCR 도메인 혹은 hammerhead구조는 바이로이드를 분류하는데 중요한 기준으로 이용되어 왔다. 예로서 Pospiviroidae과(科)의 바이로이드는 CCR 도메인이 완전히 존재하고 hammerhead self-cleavage능력 부족하다. 반면에 Assunviroidae과(科)의 바이로이드는 CCR 도메인이 부족하고 hammerhead self-cleavage능력이 있다. 바이로이드의 다양성에 관한 분자생물학적 연구는 "CCR 도메인과 hammerhead self-cleavage능력의 경우 어떤 바이로이드 계통에서 분리주(isolate)가 달라도 큰 차이가 없다"고 보고하고 있다. 이러한 연구는 바이로이드 유전자의 특정 부위 혹은 유전자 염기서열 정도아 바이로이드의 생활환(life-cycle)에 있어서 얼마나 중요한가를 결정짓는데 실질적으로 기여한다.
스페인 Espinardo 대학의 Amari와 동료들은 "16개 새로운 Hop stunt viroid(HSVd)의 RNA 분자에는 변화하지 않는 부위와 보존성 hammerhead-like structure가 존재한다"고 Journal of General Virology지 최근호(82:953-962)에 발표하였다.
Amari와 동료들은 키프로스, 그리스, 모로코, 터키에서 수집한 시료로부터 16개의 새로운 HSVd를 분리하였고 바이로이드 RNA 분자의 변이정도를 비교하고 계통도를 분석하였다. 그 결과 그들은 "이들 바이로이드 분리주는 모두 5개 집단으로 나눌 수 있었으며, 세가지 주요 집단( plum-type, hop-type, citrus-type)은 제한된 수의 기주에서 분리되었고 나머지 마이너 집단은 이들 세 가지 주요집단에 속하는 바이로이드 분리주 간에 발생한 재조합 현상에 의해 생겨났다"고 보고하였다.
또한 "바이로이드 RNA의 다양성 비교에서 대부분의 변이는 P와 V 도메인에서 발견되었으며 TR과 TL 도메인인 변이 정도가 낮거나 전혀 없었다. 그리고 계통발생분석에서 마이너 집단에 속하는 바이로이드에는 이전에 생각했던 것 보다 훨씬 더 많은 유전자 변이가 있었으며, HSVd의 TR 도메인에서 발견된 hammerhead-like sequence에는 큰 변화가 없었다"고 보고하였다.
Author for correspondence: Vicente Pallas. Fax +34 96 3877859. e-mail vpallas@ibmcp.upv.es
(소스 : Journal of General Virology (2001), 82, 953-962.)
(본 내용은 한국과학기술정보연구원과 정보이용 협약을 맺고 제공되며 저작권은 한국과학기술정보연구원에 있습니다.)
[농림수산]Hop stunt viroid의 변이분석
정보제공 : 한국과학기술정보연구원(KISTI) 해외과학기술동향